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质量工程截至2014年6月，学校有国家级教学改革试点专业1个，省级教学改革试点专业1个，省级特色专业5个，省级精品课程22门。 国家级教学改革试点专业 计算机网络。 省级教学改革试点专业 土地管理。 省级特色专业 国土资源管理、园艺技术、畜牧兽医、食品营养与检测、会计（注册会计师方向）。 省级精品课程 土地估价、大学语文、花卉栽培、园林规划设计、建设用地管理能力课程群（土地利用规划、建设用地管理、地籍管理、土地市场管理）、植物保护技术联合课程群（植物化学保护、园林植物病虫害防治技术、园艺植物病虫害防治技术、作物病虫害防治技术）、市场营销课程群（市场营销学、市场调查与预测、商务谈判、营销策划、公共关系）、食品检验与质量控制课程群（食品仪器分析、食品微生物检验、食品分析技术、食品感官检验、食品质量管理）。 教学成果截至2013年6月，学校学生先后荣获省级以上奖励121项，其中获全国大学生英语竞赛、“用友杯”大学生创业设计暨模拟经营大赛等全国性大赛特等奖13项、一等奖22项。由学校学生创演的作品《咱爹咱爸》荣获教育部门二等奖，《缤纷四季》系列活动荣获山东省高校文体活动类一等奖。 馆藏资源据2014年8月学校图书馆官网显示，图书馆馆藏纸质文献39万册，合订本期刊2万余册。年订购期刊1097份、报纸160余种。在电子资源方面，拥有中国知网、超星读秀等大型数据库，电子图书300万种。图书馆是CALIS、CASHL的成员馆，共享中国高等教育文献保障系统提供的资源与服务，以及中国高校人文社会科学文献中心提供的外文文献传递服务。 学术期刊学校出版的《山东农业工程学院学报》被维普《中文科技期刊数据库》收录，被国家图书馆和上海图书馆馆藏，主要栏目有农民问题、农村改革、农业发展、经济与管理、社会与历史、政治与法律、文化与文学、农业工程与技术。

《华北农学报》(双月刊)《农业现代化研究》《浙江海洋学院学报(自然科学版)》《山东农业大学学报》(自然科学版)《福建农林大学学报(自然科学版)》(双月刊)《上海交通大学学报》(农业科学版)(双月刊)