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一、学术论文1、添加香蕉和不同激素成份的培养基，对虎头兰原球茎器官分化的影响 华南师范大学学报(自然科学版) 1997,7:36-39 独著；2、石耳对中枢神经的抑制作用 中国中医药杂志1998,5(5):50-51 第一作者；3、食用菌与癌症的免疫疗法 广东科技 1998,10 第一作者；4、杏鲍菇对小鼠胃排空的影响 中药材 2006,29(11):1226-1227第一作者；5、白灵菇提取液对小鼠胃排空的影响 中国食用菌 2006,25(6): 27-28独著；6、姬松茸多糖化学组分及其药理作用的研究进展 中国食用菌2007,26(1):3-6第一作者；7、虎奶菇的化学成分与药理作用研究 中国食用菌 2007,26(5):3-7 第一作者；8、灰树菇提取液对小鼠小肠推进功能的影响 中药材2007,30(12):1576-1578 第一作者；9、抗组氨酰-tRNA合成酶单克隆抗体的制备及初步鉴定 中山大学学报（医学科学版）2008,29(5):606-610 第一作者。二、教研论文从高中生物科会考看中学生物学教学改革 生物学教学1998,6:14-16第一作者。三、著作1、《二十世纪科技与教育成就大观——生物技术成就大观》，中国人事出版社，1998年9月，　主编及参编；2、《21世纪科技与教育发展大观》，中国人事出版社，2001年1月，主编及参编；3、《食用菌栽培学》，天津科技出版社，2000年8月，主编及参编；4、《高中生物—校本培训指导手册》，广东高等教育出版社，2008年12月，编者之一（10万字）

在科学研究上，李玉主持国家自然科学基金项目、科技部“863”项目、农业部“948”项目等40余项。在国内外收集、评价上万份菌种和凭证标本，报道了45个新种，100余个国内新记录种。筛选并培育出39个食用菌品种，有6个品种通过国家认定，获得发明专利5项，集成创新了6个北方主要食用菌标准技术体系，指导培训技术骨干8000多人，带动农户3万户，累计推广面积50多亿袋，创造直接经济效益近60亿元。研究成果处于国际领先水平，在国内外学术刊物上发表学术论文313篇，其中34篇被“SCI”收录或引用，出版著作17部。先后获国家自然科学二等奖1项，国家教学成果二等奖1项，吉林省科技进步一等奖2项，获得专利6项，对我国的菌物事业做出突出贡献。在产业化理论方面，李玉率先提出了食用菌产业是“循环经济”发展模式中重要的产业一环，提升了食用菌产业的地位。针对吉林省地处黄金玉米带、产量高效益低这一“新东北现象”，提出了“南菇北移”、“东木西草”、“建设百公里食药用菌长廊”等合理化建议，被省政府采纳，并付诸实施成为新的产业亮点。在人才培养方面，李玉甘当人梯，培养了菌物学领域的硕士研究生100余名，博士研究生40余名，博士后40余名。在我国创建了较完整的菌物科学与食用菌工程人才培养体系。在产学研平台建设方面，李玉建立了“食药用菌教育部工程研究中心”、“吉林省食用菌创新中心”、“中俄菌物资源保育中心”、“中国白俄罗斯菌物资源保育中心”。创办了《菌物研究》杂志。创建了食用菌专科专业和应用生物科学（食药用菌方向）本科专业、建成相关的博士点和博士后流动站并成为省部级重点学科、国家重点实验室（培育基地）, 在国内率先形成了专科、本科、硕士、博士、博士后的较完整的菌物学科体系。建设了21个产业化示范基地。主持召开了“第八届海峡两岸菌物学学术研讨会”、“中日及泛亚太地区菌物学论坛”、“ 第五届国际药用菌大会”等多次国内外大型学术会议，扩大了吉林农业大学及菌物学科在国际上的影响，为菌物学科搭建了良好的产学研平台。中国工程院院士是国家设立的工程科学技术方面的最高学术称号，为终身荣誉。其院士增选工作每两年进行一次，每次增选名额不超过60名。此次增选后，中国工程院院士已达756名。目前吉林省“两院”院士人数为30人，而从省属单位走出的院士，李玉还是第一人。原吉林省省长韩长赋在考察吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心时说，李玉教授被评为中国工程院院士是吉林农业大学的光荣，是吉林省属高校的光荣，也是吉林省农业的光荣、吉林省全省的光荣。